缺乏明確的戰略規劃：工程項目管理軟件的實施需要與企業戰略緊密結合，確保系統的目標與企業的目標一致。缺乏清晰的戰略規劃可能導致系統功能和需求不匹配，從而導致實施失敗。

　　不合理的期望值：有些企業過于理想化地期望工程項目管理軟件系統能立即解決所有問題，忽視了實施過程中的復雜性和需求的變動。這種不合理的期望值會導致實施壓力過大，最終導致失敗。

　　人員參與不足或不合適：工程項目管理軟件實施需要全體員工的積極參與和支持，但有些企業忽視了員工培訓和意見的聽取。員工參與不足或者不合適的人員參與會阻礙系統的推廣和應用，導致實施失敗。

　　技術問題：包括網絡基礎設施不完善、硬件設備與系統要求不匹配等。大多數傳統型建筑企業容易存在此類問題，而且缺少專職的網絡管理員，技術問題可能導致系統的穩定性和性能存在隱患，影響實施效果。

　　溝通與協調問題：工程項目管理軟件實施需要涉及多部門和多人員的合作與協調。若溝通不暢、信息不準確，會導致各相關部門工作不協調，最終導致軟件實施失敗。

　　管理基礎薄弱：企業缺乏實施工程項目管理軟件的前提條件，如業務流程再造的問題，而是面臨業務流程新建的挑戰。長期缺乏先進理念始終如一的貫徹，也使得企業無法實施與運用奠定在一定管理學指導下的工程項目管理軟件系統。

　　匱乏相應的工程項目管理軟件實施人才：企業自行開發軟件費時、費錢，究其原因是人才匱乏;軟件供應商各有長短，用戶難以辨別優劣及適用性。新知識面廣、量大，更新速度快，難以全面掌握;企業個性與行業個性差異大，企業管理基礎與側重點各有不同，導致難以開發出既先進又經濟實用且能具有市場推廣價值的軟件。

　　因此，要解決工程項目管理軟件在中小企業的實施難題，企業需要先一步制定明確的戰略規劃，并根據實際情況建立合理的期望值，加強人員培訓和參與，完善技術基礎設施，加強溝通與協調等。同時，對于管理基礎薄弱的中小企業來說，提升管理水平，進行業務流程再造和優化也是至關重要的。